Palazzo Pignano è stato un luogo importantissimo per tutto il Medioevo. Solo nel 1450 infatti Crema venne dichiarata città dalla Repubblica di Venezia ed il parroco di Palazzo Pignano che era anche il vicario del Vescovo di Piacenza chiese di essere trasferito con i suoi sacerdoti nella città di Crema. Palazzo Pignano perse quindi la sua importanza e nel 1580 si staccò definitivamente dalla Diocesi di Piacenza, per far parte della nuova Diocesi di Crema.